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Clone Manager Professional提供了一套集成的工具,用于酶操作、克隆模擬、圖形圖繪制、引物設(shè)計和分析、全局和局部序列比對、相似性搜索和實驗室規(guī)模的序列組裝項目。
您還可以使用Clone Manager作為一種快速、簡單的方法來查看或編輯序列文件、查找開放閱讀框、翻譯基因、查找文件中的基因或文本,或者使用引物或序列短語集合。
分子查看器窗口將所有分子信息集中在一個方便的位置。點擊窗口底部的標簽,可查看分子圖譜、限制性圖譜數(shù)據(jù)、序列、特征表或分子信息。

分子查看器窗口,地圖視圖

連接視圖
Clone Manager就像一個系統(tǒng),幫助你進行克隆模擬、酶操作和圖形繪制。Clone Manager會查找限制性酶切位點、切割分子、修改末端和連接DNA。
在所有這些操作中,Clone Manager都會跟蹤你的特征和酶切位點,并自動對新分子中的位置重新編號。快速而強大的限制酶分析功能將幫助你找到酶來完成所需的操作。一套克隆向?qū)Э梢詭椭闶褂卯斍暗目寺〖夹g(shù)模擬克隆。
分子圖形地圖繪制快速準確,高分辨率地圖可發(fā)送到打印機或Windows剪貼板,供其他應(yīng)用程序使用。使用圖形地圖的 "增強視圖 "自定義特殊分子地圖,以便在演示文稿或出版物中使用。額外的字體、顏色、樣式和線寬控制可幫助您制作一些特別的地圖。
Clone Manager Professional可用于執(zhí)行多序列比對、局部比對和序列相似性快速掃描。該程序可勝任處理大量分子和大序列。比對結(jié)果顯示在一個標簽式查看窗口中,結(jié)果可以打印或復(fù)制到Windows剪貼板。您還可以為實驗室規(guī)模、簡單或復(fù)雜的項目組裝序列,或定位亞克隆。
Clone Manager Professional可以在目標區(qū)域找到optimal primers的 "簡短列表"。您還可以在目標位置的分子序列中定位引物,并查看引物評估、引物側(cè)翼序列、附近的基因以及符合設(shè)定標準的鄰近引物的位置。使用測序引物向?qū)В⊿equencing Primer Wizard)設(shè)計一組引物,對分子區(qū)域進行測序。將引物保存到磁盤上的內(nèi)置收集文件或引物文件中。搜索引物集,找到與任意感興趣分子上的結(jié)合位點相匹配的引物。
克隆操作
模擬克隆
繪制圖形地圖,增強視圖
使用酶
序列分析功能
克隆向?qū)В篏ateway、Gibson、In-Fusion、NEBuilder、拓撲異構(gòu)酶、Golden Gate、Crispr 敲除、PCR等
引物設(shè)計、分析
設(shè)計引物,創(chuàng)建擴增產(chǎn)物
分析引物、分析混合物
找到與您的分子結(jié)合的引物
組織、使用館藏中的引物
對齊操作
對齊多個序列
比較兩個序列
掃描相似性、BLAST搜索
組裝序列,定位亞克隆
其他特性
集成序列編輯器和文件處理程序
廣泛的序列格式化選項
序列短語集合、引物集合、內(nèi)置DataBook數(shù)據(jù)庫
使用云存儲服務(wù)共享分子
【英文介紹】
Clone Manager Professional provides a comprehensive, fully integrated set of tools for enzyme operations, cloning simulation, graphic map drawing, primer design and analysis, global and local sequence alignments, similarity searches, and laboratory-sized sequence assembly projects.
You can also use Clone Manager as a quick and easy way to view or edit sequence files, find open reading frames, translate genes, find genes or text in files, or use primer or sequence phrase collections.
Cloning Operations
Simulate cloning
Draw graphic maps, Enhanced views
Work with enzymes
Sequence analysis functions
Cloning wizards: Gateway, Gibson, In-Fusion, NEBuilder, Topoisomerase, Golden Gate, Crispr knockout, PCR and others
Primer Design, Analysis
Design primers, create amplified products
Analyze primers, analyze mixes
Find primers that bind to your molecule
Organize, use primers in collections
Alignment Operations
Align multiple sequences
Compare two sequences
Scan for similarities, BLAST searches
Assemble sequences, locate subclones
Other Features
Integrated sequence editor and file handler
Extensive sequence formatting options
Sequence phrase collections, primer collections, built-in DataBook database
Share molecules using cloud storage services