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Clone Manager Professional提供了一套集成的工具,用于酶操作、克隆模擬、圖形圖繪制、引物設(shè)計(jì)和分析、全局和局部序列比對(duì)、相似性搜索和實(shí)驗(yàn)室規(guī)模的序列組裝項(xiàng)目。
您還可以使用Clone Manager作為一種快速、簡(jiǎn)單的方法來查看或編輯序列文件、查找開放閱讀框、翻譯基因、查找文件中的基因或文本,或者使用引物或序列短語集合。
分子查看器窗口將所有分子信息集中在一個(gè)方便的位置。點(diǎn)擊窗口底部的標(biāo)簽,可查看分子圖譜、限制性圖譜數(shù)據(jù)、序列、特征表或分子信息。

分子查看器窗口,地圖視圖

連接視圖
Clone Manager就像一個(gè)系統(tǒng),幫助你進(jìn)行克隆模擬、酶操作和圖形繪制。Clone Manager會(huì)查找限制性酶切位點(diǎn)、切割分子、修改末端和連接DNA。
在所有這些操作中,Clone Manager都會(huì)跟蹤你的特征和酶切位點(diǎn),并自動(dòng)對(duì)新分子中的位置重新編號(hào)??焖俣鴱?qiáng)大的限制酶分析功能將幫助你找到酶來完成所需的操作。一套克隆向?qū)Э梢詭椭闶褂卯?dāng)前的克隆技術(shù)模擬克隆。
分子圖形地圖繪制快速準(zhǔn)確,高分辨率地圖可發(fā)送到打印機(jī)或Windows剪貼板,供其他應(yīng)用程序使用。使用圖形地圖的 "增強(qiáng)視圖 "自定義特殊分子地圖,以便在演示文稿或出版物中使用。額外的字體、顏色、樣式和線寬控制可幫助您制作一些特別的地圖。
Clone Manager Professional可用于執(zhí)行多序列比對(duì)、局部比對(duì)和序列相似性快速掃描。該程序可勝任處理大量分子和大序列。比對(duì)結(jié)果顯示在一個(gè)標(biāo)簽式查看窗口中,結(jié)果可以打印或復(fù)制到Windows剪貼板。您還可以為實(shí)驗(yàn)室規(guī)模、簡(jiǎn)單或復(fù)雜的項(xiàng)目組裝序列,或定位亞克隆。
Clone Manager Professional可以在目標(biāo)區(qū)域找到optimal primers的 "簡(jiǎn)短列表"。您還可以在目標(biāo)位置的分子序列中定位引物,并查看引物評(píng)估、引物側(cè)翼序列、附近的基因以及符合設(shè)定標(biāo)準(zhǔn)的鄰近引物的位置。使用測(cè)序引物向?qū)В⊿equencing Primer Wizard)設(shè)計(jì)一組引物,對(duì)分子區(qū)域進(jìn)行測(cè)序。將引物保存到磁盤上的內(nèi)置收集文件或引物文件中。搜索引物集,找到與任意感興趣分子上的結(jié)合位點(diǎn)相匹配的引物。
克隆操作
模擬克隆
繪制圖形地圖,增強(qiáng)視圖
使用酶
序列分析功能
克隆向?qū)В篏ateway、Gibson、In-Fusion、NEBuilder、拓?fù)洚悩?gòu)酶、Golden Gate、Crispr 敲除、PCR等
引物設(shè)計(jì)、分析
設(shè)計(jì)引物,創(chuàng)建擴(kuò)增產(chǎn)物
分析引物、分析混合物
找到與您的分子結(jié)合的引物
組織、使用館藏中的引物
對(duì)齊操作
對(duì)齊多個(gè)序列
比較兩個(gè)序列
掃描相似性、BLAST搜索
組裝序列,定位亞克隆
其他特性
集成序列編輯器和文件處理程序
廣泛的序列格式化選項(xiàng)
序列短語集合、引物集合、內(nèi)置DataBook數(shù)據(jù)庫
使用云存儲(chǔ)服務(wù)共享分子
【英文介紹】
Clone Manager Professional provides a comprehensive, fully integrated set of tools for enzyme operations, cloning simulation, graphic map drawing, primer design and analysis, global and local sequence alignments, similarity searches, and laboratory-sized sequence assembly projects.
You can also use Clone Manager as a quick and easy way to view or edit sequence files, find open reading frames, translate genes, find genes or text in files, or use primer or sequence phrase collections.
Cloning Operations
Simulate cloning
Draw graphic maps, Enhanced views
Work with enzymes
Sequence analysis functions
Cloning wizards: Gateway, Gibson, In-Fusion, NEBuilder, Topoisomerase, Golden Gate, Crispr knockout, PCR and others
Primer Design, Analysis
Design primers, create amplified products
Analyze primers, analyze mixes
Find primers that bind to your molecule
Organize, use primers in collections
Alignment Operations
Align multiple sequences
Compare two sequences
Scan for similarities, BLAST searches
Assemble sequences, locate subclones
Other Features
Integrated sequence editor and file handler
Extensive sequence formatting options
Sequence phrase collections, primer collections, built-in DataBook database
Share molecules using cloud storage services