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為什么使用FCS Express?
想學習FCS Express?你已經(jīng)開始了!
知道如何使用Microsoft PowerPoint嗎?Excel怎么樣?
學習如何使用流式細胞術軟件不應成為數(shù)據(jù)中獲取結果的障礙。FCS Express的設計外觀、感覺和工作方式與很多熟悉的Microsoft Office程序相似。
從FlowJo切換到FCS Express?
如果您發(fā)現(xiàn)自己經(jīng)常需要將表格和圖形復制并粘貼到其他軟件包,那么FCS Express可能就是您的理想選擇!
集成電子表格使分析變得簡便
想象一下,擁有Excel的強的功能,結果直接鏈接到您的大門。使用FCS Express電子表格可以直接在您的分析中訪問并鏈接到您的跟前和數(shù)據(jù)文件。隨著移動和數(shù)據(jù)的變化,您的電子表格也會實時變化。
FCS Express特點
FCS Express流式細胞術和圖像細胞術軟件專注于將您的流式細胞術和圖像細胞術數(shù)據(jù)轉化為結果。
FCS Express使您能夠使用工具進行快速數(shù)據(jù)分析、創(chuàng)建可發(fā)布的圖表、提供門控工具等。通過直接導出為PowerPoint、PDF、Excel、Word和高分辨率圖像格式,更快的獲得結果。
Pipelines
FCS Express中的Pipelines是一組獨立或串聯(lián)的數(shù)據(jù)處理步驟。一個步驟的輸出可以用于數(shù)據(jù)文件或用作下一步或一系列步驟的輸入,這些步驟可能應用于您的數(shù)據(jù)。沒有插件,沒有編程,只有結果!
絕大多數(shù)常用的數(shù)據(jù)分析算法實際上都是pipelines,tSNE(及其變體)和SPADE就是兩個例子。但是,當這些算法作為一個計算來實現(xiàn)時,用于自定義只限于特定實現(xiàn)所允許的范圍。FCS Express中的pipelines增加了運行算法和數(shù)據(jù)轉換的計算靈活性和粒度,同時為用戶提供了創(chuàng)建自己的轉換和能力。
Pipelines由單獨的數(shù)據(jù)處理步驟組成,每個步驟執(zhí)行特定的計算/轉換。
預定義的流水線步驟(FlowAI、FlowCut、FlowSOM、SPADE等)使訪問常用算法和數(shù)據(jù)處理步驟變得簡便。
FCS Express提供了多種流水線步驟供您選擇。
綜合電子表格
您是否曾想要將文件、gates和圖表中的統(tǒng)計數(shù)據(jù)直接鏈接到Excel?FCS Express提供集成的電子表格,當gates和數(shù)據(jù)使用tokens實時更新gates或數(shù)據(jù)變化。
拖放gates種群以填充電子表格。從數(shù)據(jù)列表中提取很多數(shù)據(jù)文件到電子表格中,以比較樣品并自動生成結果。
您已經(jīng)知道如何使用電子表格。
使用很多您知道的高等Excel工具(包括條件格式)自定義電子表格,以便您可以更輕松、更快速的獲得結果。
尋找公式函數(shù)?FCS Express為您提供了Excel中提供的很多相同公式。
電子表格公式提供開始分析所需的全部詳細信息。跳過手動查找并直接查看結果!
出版就緒的圖形
對于您的數(shù)據(jù),出版質量的結果很緊要。每次您以多種格式以任意分辨率分析樣本時,F(xiàn)CS Express都會提供可發(fā)布的圖形。
適合您分析的正確繪圖總是觸手可及。
在分析時或通過創(chuàng)建默認值自定義繪圖的各個方面,以便您準備好立即從原始數(shù)據(jù)轉移到您的出版物。
使用自定義標簽和網(wǎng)格線或刻度線格式化您的任意軸。
使用黑白或灰度圖來避免彩頁費用。
Clinical Edition
FCS Express IVD是在FDA上市的第三方流式細胞儀數(shù)據(jù)分析軟件。De Novo Software通過創(chuàng)建和遵守政策和程序以滿足21 CFR §820的嚴格要求和復雜法規(guī),致力于FCS Express的高質量。
使用統(tǒng)計分類器自動對數(shù)據(jù)進行定性評估。
使用條件語句和標記來自動控制何時運行批處理操作。
用預設評論描述分析和結果。拖放以將您的解釋添加到布局和批處理到LIS。
使用帶時間戳的電子簽名驗證分析和布局狀態(tài)。
CFR 第11部分合規(guī)性
通過結合日志記錄功能,確保您的流式細胞術數(shù)據(jù)分析符合CFR第11部分。除了復雜的加密、打印日志記錄、打印標記、密碼老化和很多其他功能外,F(xiàn)CS Express還可以節(jié)省時間和很多合規(guī)性工作。
在用戶和布局級別控制軟件中的數(shù)百個操作。
記錄所做的每一個工作。登錄FCS Express會生成帶有時間戳的數(shù)字文件,記錄為審核所做的每項操作。打印或另存為PDF以存檔審計跟蹤。
為您的用戶創(chuàng)建電子簽名以驗證布局狀態(tài)并將信息直接導出到您的LIS。使用tokens,可以強制執(zhí)行簽名指令,其中需要先簽署來自一個特定簽名組的簽名,然后才能允許來自另一個簽名組的簽名。
在審計跟蹤中跟蹤和報告系統(tǒng)級操作并增強您對法規(guī)要求的遵守。
光譜分析
利用能夠顯示來自Cytek和Sony儀器的光譜數(shù)據(jù)的第三方軟件。
應用gates沿著光譜可視化感興趣的子集。
創(chuàng)建gates以進一步分析人口或早其他地塊上設置gates。
在單個圖中疊加多個樣本或群體,以便于進行視覺比較。
直接在FCS Express中從單一染色對照執(zhí)行光譜分離。當對補償設置和/或直接矩陣進行調整時,您的流式細胞術分析將立即更新,以幫助您立即根據(jù)您的控制可視化變化。
還可以為添加布局的任意已創(chuàng)建或導入的分解矩陣創(chuàng)建可視化矩陣。FCS Express將生成一個可視化矩陣,只需在補償和取消混合編輯器中右鍵單擊所需的取消混合矩陣,選擇構建可視化矩陣。可視化矩陣頁面包括一個帶有圖表值的電子表格和一個顯示檢驗器與強度的圖表,用于在自動分離設置中添加的每個單一染色控制。
FCS Express使查看未混合的光譜特征變得簡單方便??梢暬仃囀潜姸嘈鹿δ苤?,可使您在FCS Express中的分析更上一層樓。
圖像細胞術
借助FCS Express Image Cytometry,利用廣泛使用的流式細胞術數(shù)據(jù)分析工具來加速您的圖像細胞術分析。進一步使用圖片繪圖和數(shù)據(jù)網(wǎng)格,單擊一下即可從種群深入到單個細胞。
在Picture Plots中對圖像感興趣的區(qū)域設置門控,并查看分析在其他門控的反向設置。
選擇感興趣的單元格或在數(shù)據(jù)網(wǎng)格中創(chuàng)建單元格庫。
數(shù)據(jù)轉換-tSNE/SPADE/k-means等等...
數(shù)據(jù)轉換允許您通過FCS Express中的各種算法創(chuàng)建自定義參數(shù),并直接與R集成。轉換導航器是一個直觀的對話框,可以通過快速拖放輕松的將轉換應用于繪圖。
通過易于使用的界面生成令人驚嘆的tSNE/viSNE圖。
從您的數(shù)據(jù)創(chuàng)建SPADE樹,這些樹會隨著gates和數(shù)據(jù)的變化而實時更新。
集成的k-means工具簡化了聚類分析。
主成分分析在轉換導航器中可用。
當您的分析需要定制方法時, 直接在FCS Express中執(zhí)行R腳本 。
輕松補償
FCS Express允許您通過讀取數(shù)據(jù)文件、手動調整或使用控件從頭開始構建來輕松創(chuàng)建和應用補償。
以您需要的任意方式加載和編輯補償。
使用您的單染和未染色對照快速進行自動補償設置以創(chuàng)建補償。
使用滑動條或在補償導航器中定義輔助因子,直接從圖中快速編輯的調整補償。每當影響補償設置或矩陣本身發(fā)生任意變化時,結果都會實時更新。
溢出擴散矩陣(SSM)和交叉染色指數(shù)(CSI)矩陣均在補償/分離向導結束時自動計算。
批量處理
使用批處理不只可以加速大量樣品的批量分析,還可以通過單擊創(chuàng)建PDF、PPT、XLS等。
使用相同的門控策略分析樣本時同時生成報告文件。
在FCS Express IVD中使用條件語句和標記控制何時運行批處理操作。
通過自定義其選項,定義如何以及在何處保存從批次創(chuàng)建的每個報告。
統(tǒng)計數(shù)據(jù)
通過使用標準統(tǒng)計 、統(tǒng)計測試或在FCS Express中創(chuàng)建自定義計算來節(jié)省時間。使用集成電子表格以類似于Excel的格式獲取統(tǒng)計信息。當gates移動或數(shù)據(jù)更改時,所有值將實時更新。
通過將統(tǒng)計數(shù)據(jù)添加到批處理過程中,避免將統(tǒng)計數(shù)據(jù)寫在紙上以供進一步分析的單調乏味。
在布局中的任意位置插入統(tǒng)計信息 - 圖表、文本框、自定義表格和 電子表格。
使用FCS Express IVD中的分類器根據(jù)統(tǒng)計數(shù)據(jù)進行實時更新的定性評估。
細胞周期分析
通過使用Multicycle AV進行細胞周期分析,清理繁瑣且通常有偏見的手動門控 。FCS Express的每個副本中都包含一個不需要費用的版本,可以顯示三個周期的Pro版本可以購買。
您的樣本將按照門控或非門控數(shù)據(jù)的顯示進行建模。
自定義多周期圖以顯示您的結果,以便共享或報告您需要的方式。
解釋指南和統(tǒng)計數(shù)據(jù)可以插入到布局中并包含在批處理中。
增殖分析
使用FCS Express中的集成建模,避免手動定義增殖數(shù)據(jù)的世代。該模型使用復雜的linear least-squares擬合過程,提取您需要的信息和統(tǒng)計數(shù)據(jù)。
使用自定義配色方案讓您的數(shù)據(jù)有效起來。
或者...
簡化圖形以黑白或灰度發(fā)布。
調整擬合參數(shù)以優(yōu)化數(shù)據(jù)建模。
有關模型擬合的統(tǒng)計數(shù)據(jù)和信息可以插入到布局中并包含在批處理中。
BD部門和Accur匯入
導入BD FACSDiva和Accuri儀器的實驗, 無需在采集后重新創(chuàng)建繪圖和門控,從而節(jié)省時間。根據(jù)需要更新門控策略或自定義圖,并運行批處理以從實驗中的所有樣本創(chuàng)建結果。
Diva to FCS Express
所有采集模板和分析工作表
原生、高分辨率、浮點FCS數(shù)據(jù)
所有具有適當門控層次結構的門
所有補償設置
所有標記和象限
Accuri to FCS Express
收集和分析選項卡上的所有圖
原生、高分辨率、24 位 FCS 數(shù)據(jù)
所有具有適當門控層次結構的門
所有補償設置
所有標記和象限
所有繪圖格式設置
Accuri
FCS Express
高內涵篩選
使用 FCS Express中的熱圖輕松可視化和分析基于板的數(shù)據(jù)集、索引排序以及流式和圖像細胞術分析的篩選。
在單個圖中表示多個樣本的多個統(tǒng)計數(shù)據(jù)和參數(shù)。
應用gates以只顯示感興趣的事件或創(chuàng)建gates以聚合感興趣的孔/樣本,例如重復。
選擇配色方案并定義顏色級別以自定義您的熱圖并使其脫穎而出。
讓FCS Express為您的熱圖中的全部或選定的孔和簇自動創(chuàng)建門控。
質量控制
FCS Express提供質量控制工具來標準化您的數(shù)據(jù)分析并提高整個團隊的一致性。
通過IQ/OQ程序確保FCS Express的安裝、配置和操作正確,以便您驗證工作。
按需或在批處理期間自動運行質量控制檢查并發(fā)出警報。
使用權限規(guī)則定義允許哪些操作、由誰以及何時進行。結合標準操作程序 (SOP) 構建器來標準化分析。
控制對象(圖、門、頁面等)何時在布局上可見。
合并數(shù)據(jù)文件
合并數(shù)據(jù)文件是在單個圖上加載和可視化多個文件的便捷方式,在 FCS Express中執(zhí)行轉換時特別有用。文本信息或分類文件標識符可用于識別合并數(shù)據(jù)文件中包含的每個數(shù)據(jù)文件。分類文件標識符現(xiàn)在可以顯示在二維圖上,以便使用門和/或標記直接識別特定文件。FCS Express使處理合并的數(shù)據(jù)文件變得無憂無慮。
記住縮放公式
FCS Express會記住手動調整的縮放比例。用戶不再需要調整每個圖,一旦對圖參數(shù)進行了更改,所有顯示相同參數(shù)的圖都會自動更新。優(yōu)化數(shù)據(jù)在繪圖上的顯示方式從未如此簡單。
操作系統(tǒng):
Windows:FCS Express 7可在Windows 7/Windows 8/Windows 8.1/Windows 10/Windows 11上運行。
32位 FCS Express將在32位或64位環(huán)境中運行。
64位 FCS Express將在64位環(huán)境中運行。
Mac:
如果使用 FCS Express 7:
macOS 13 (Ventura) 尚未全部驗證是否支持FCS Express 7。
請注意,要在macOS 13上運行FCS Express 7,請確保關閉“Stage Manager”。
當與macOS 11.6或更高版本一起使用時,F(xiàn)CS Express 7.10.0007及更高版本支持基于ARM的Mac(M1 Apple Silicon)。
支持macOS 10.13 (High Sierra) 到macOS 11.x (Big Sur)。
FCS Express 7.12.0005、7.12.0007及更高版本支持macOS 12.2.1 (Monterey)。
如果使用macOS Monterey 12.3。和Monterey版本,兼容FCS Express 7 v7.12.0009或更高版本。
macOS與網(wǎng)絡許可證不兼容。
如果使用FCS Express 6,則支持macOS 10.8 (Mountain Lion) 到macOS 10.14 (Mojave)。
FCS Express 5或更低版本可以在Mac上的 Windows虛擬機環(huán)境中運行,使用Parallels、VMWare Fusion或Boot Camp等軟件。
【英文介紹】
FCS Express? gets you from raw data to easily-understandable, beautifully formatted, presentation-ready results more easily and in less time than any other flow cytometry software.
Why Use FCS Express?
Want to Learn FCS Express? You've Already Started!
Know how to use Microsoft PowerPoint?? How about Excel??
Learning how to use flow cytometry software should not be an impediment to getting results from your data. FCS Express is designed to look, feel, and work like many familiar Microsoft Office? programs so you are already half way to being an expert with the software before you even get started.
Making the switch from FlowJo? to FCS Express?
If you are currently using FlowJo and are having trouble arriving at publication quality results, find it hard learning an unfamiliar software interface, find yourself constantly having to copy and paste tables and graphics to other software packages, then FCS Express might be just what you are looking for!
Integrated Spreadsheets Make Analysis Easy
Imagine having the power of Excel with results linked directly to your gates. With FCS Express spreadsheets can be accessed directly in your analysis and linked up to your gates and data files. As gates move and data changes, so do your spreadsheets in real time. Say good bye to copy and paste and hello to results!