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CopyCount:qPCR曲線擬合以確定每個孔中的全部拷貝數(shù)。CopyCount(qPCR分析軟件)將每個qPCR反應(yīng)轉(zhuǎn)換為全部拷貝數(shù)測定。
什么是CopyCount?
CopyCount分析qPCR熒光數(shù)據(jù)的形狀,以推斷出循環(huán)零時目標DNA/RNA的全部拷貝數(shù)。不需要標準曲線、樣品稀釋或過多的重復(fù)—而是可以分析每條單獨的qPCR曲線以提供全部拷貝數(shù)。這對于確定病毒載量、細菌載量、參考庫標準化和其他應(yīng)用很有用。
CopyCount減少了對過多重復(fù)和標準曲線的需求,并增加了平板上用于未知物而非標準品的空間,從而為您節(jié)省了時間和金錢。
CopyCount的結(jié)果易于解釋:CopyCount給出循環(huán)零時的DNA分子數(shù)。不再需要數(shù)學體操來解釋復(fù)雜的Ct值。
CopyCount使用您現(xiàn)有的qPCR儀器,而不是昂貴的數(shù)字PCR儀器。
量化的問題
目前獲得PCR定量需要費力的制備標準品和獲得標準曲線,從而浪費試劑和使用寶貴的板空間。此外,傳統(tǒng)的qPCR分析方法確定了“循環(huán)閾值”,即Ct或Cq,它因不同的檢測、不同的機器和不同的板而不同,從而使Ct值難以解釋。
使用qPCR CopyCount解決定量問題
DNA軟件在理解PCR擴增機制方面取得了突破。新產(chǎn)品qPCR CopyCount允許分析全部qPCR曲線,以直接確定循環(huán)零時DNA的拷貝數(shù)。DNA拷貝計數(shù)是每個生物學家都想要的數(shù)量,而qPCR CopyCount提供的結(jié)果具有相對和準確性。
qPCR CopyCount作為數(shù)字PCR的替代方案如何使您的研究受益?
DNA拷貝數(shù)結(jié)果比Ct方法準確3-4倍
減少了兩個常見的用戶錯誤來源,即標準品的量化和標準曲線的運行
使用現(xiàn)有的qPCR儀器加速您的工作流程
具有成本效益的數(shù)字PCR替代品
使用現(xiàn)有qPCR儀器進行定量
利用您當前的實驗室設(shè)備和方法,并為您提供比數(shù)字PCR更高的樣品通量,qPCR CopyCount提供具有準確性的定量,誤差在5%以內(nèi)。qPCR CopyCount無需昂貴的新設(shè)備,使每個qPCR反應(yīng)都成為反應(yīng)。
降低成本
qPCR CopyCount不需要定量標準,并為用戶提供更多的樣品孔而不是對照孔。
導出格式
qPCR CopyCount要求您將每個循環(huán)的原始qPCR熒光數(shù)據(jù)上傳為基于文本的CSV/TSV文件或Excel XLS/XLSX格式。目前無法支持直接二進制格式,例如SDS和EDS文件。目前,可以自動檢測以下格式:
Abbott m2000rt
ABI 7500/7900
Bio-Rad: CFX and iCycler
Fluidigm
Life Technologies: ViiA 7, Step One, OpenArray 12K Flex
Qiagen: Rotor-Gene
Roche: LC480 and Lightcycler Series
StrataGene MX
General Column-Layout CSV
General Row-Layout CSV
【英文介紹】
qPCR curve fitting to determine absolute copy number in every well.
CopyCount (qpcr analysis software) turns every qPCR reaction into an absolute copy number determination.
What is CopyCount?
CopyCount analyzes the shape of qPCR fluorescence data to deduce the absolute number of copies of target DNA/RNA at cycle zero. There is no need for a standard curve, or sample dilution, or excessive replicates – instead every individual qPCR curve can be analyzed to give absolute copy number. This is useful for determining viral load, bacterial load, standardization of reference stocks, and other applications.
CopyCount saves you time and money by reducing the need for excessive replicates and standard curves and increases the real estate on your plate that is devoted to unknowns rather than standards.
Results from CopyCount are simple to interpret: CopyCount gives the number of molecules of DNA at cycle zero. No more mathematical gymnastics are needed to interpret complex Ct values.
CopyCount uses your existing qPCR instrumentation, rather than expensive Digital PCR instrumentation.