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DNADynamo是一款易于使用的DNA測(cè)序和分析軟件。從各種格式和在線數(shù)據(jù)庫(kù)導(dǎo)入或檢索帶注釋的序列文件。組裝測(cè)序數(shù)據(jù)，分析突變，并輸出結(jié)果。設(shè)計(jì)cloning strategies，設(shè)計(jì)primers，并創(chuàng)建漂亮的質(zhì)粒圖，可以以任意方式進(jìn)行編輯和調(diào)整。通過Clustal和Muscles插件支持DNA和蛋白質(zhì)多序列排列。對(duì)齊是可編輯的。您使用DNADynamo的次數(shù)越多，隨著您積累筆記、注釋、寡核苷酸和測(cè)序數(shù)據(jù)，您的序列文件變得更加有用。DNADynamo支持復(fù)制和粘貼子克隆，它的構(gòu)建器包括用于限制位點(diǎn)添加和自動(dòng)引物設(shè)計(jì)gibson cloning和infusion cloning strategies。還支持TOPO、TA和網(wǎng)關(guān)反應(yīng)。適用于分子生物學(xué)家在任意級(jí)別，使用DNADynamo在ncbi進(jìn)行爆炸搜索，從entrez搜索和檢索genbank文件，檢索和顯示pdb結(jié)構(gòu)文件等。
DNADynamo DNA測(cè)序和分析軟件可適用于Windows PC，包括Windows 7、Windows 10、Windows 11、MacOS/OS X 10.10.10 Yosemite、10.11 El Capitan、10.12 Sierra、10.13 High Sierra、10.14 Mojave、10.15 Catalina、11.0 Big Sur、12.0 Monterey和Linux。
DNADynamo軟件功能：
序列導(dǎo)航和限制性位點(diǎn)分析
Genbank accession U52953代表'HIV-1 92BR025 from Brazil, complete genome' 導(dǎo)入DNADynamo并顯示特征圖
abi/scf色譜圖序列排列和編輯
上方顯示區(qū)的可編輯序列排序與下方顯示區(qū)的色譜數(shù)據(jù)相聯(lián)系。在翻譯“指南“序列的同時(shí)，圖形地圖可以輕松實(shí)現(xiàn)測(cè)序差異的可視化，并說明從”特征“地圖中選擇的注釋和oligos。
自動(dòng)添加矢量特征并繪制地圖
DNADynamo的圓形地圖是可編輯的。你可以調(diào)整幾乎全部東西的大小、顏色和位置，包括設(shè)置你喜歡的字體，以及添加自定義文本標(biāo)簽。DNADynamo地圖還支持特殊的MCS顯示，并允許你添加一個(gè)特征列表和/或一個(gè)不存在的限制站點(diǎn)列表。
使用片段復(fù)制和替換計(jì)劃子克隆，或使用專用的“Construct Maker”
一個(gè)含有vpr基因的EcoRI/BamHI片段被選中。該片段可被復(fù)制，然后用于替換另一載體中選定的EcoRI/BamH1片段。
手動(dòng)設(shè)計(jì)引物或使用引物設(shè)計(jì)器自動(dòng)選擇具有給定屬性的引物，例如gibson/infusion cloning或添加限制性位點(diǎn)。
在Primer Designer中已經(jīng)選擇了一個(gè)片段，并設(shè)計(jì)了添加BamH1位點(diǎn)和EcoRI位點(diǎn)的引物。
附加功能：
Oligo編輯器和數(shù)據(jù)庫(kù)
集成網(wǎng)絡(luò)BLAST搜索和注釋
通過DNADynamo ClustalW界面進(jìn)行注釋的多序列比對(duì)
模式搜索
【英文介紹】
DNADynamo DNA sequencing and Analysis Software is easy to use. Import or retrieve annotated sequence files from a variety of formats and online databases. Assemble sequencing data, analyse mutations, and export the results. Design cloning strategies, design primers, and create beautiful plasmid maps that can be edited and adjusted any way you want. Supports DNA and Protein multiple sequence alignments via Clustal And Muscles plugins. Alignments are fully editable. The more you use DNADynamo the more useful your sequence files become as you accumulate notes, annotations, oligos and sequencing data. DNADynamo supports copy and paste sub cloning, and it's construct maker includes automatic primer design for restriction site addition or seamless gibson cloning and infusion cloning strategies. TOPO, TA and gateway reactions are also supported. Suitable for molecular biologists at any level, use DNADynamo to blast search at ncbi, search and retrieve genbank files from entrez, retrieve and display pdb structure files, and more.
DNADynamo DNA Sequencing and Analysis software is available for Windows PCs including Windows7, Windows 10, Windows 11, MacOS/OS X 10.10.10 Yosemite, 10.11 El Capitan, 10.12 Sierra, 10.13 High Sierra, 10.14 Mojave, 10.15 Catalina, 11.0 Big Sur, 12.0 Monterey and Linux.
