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LAMP Designer可以設(shè)計用于環(huán)介導等溫擴增測定的引物,在等溫條件下擴增DNA和RNA序列,無需PCR設(shè)置。該技術(shù)依賴于自動循環(huán)和DNA聚合酶介導的鏈置換DNA合成。在不到一小時的時間內(nèi)將幾個DNA拷貝擴增到109.逆轉(zhuǎn)錄偶聯(lián)LAMP可用于RNA序列的擴增。
LAMP Designer特征:
設(shè)計用于環(huán)介導等溫擴增的引物
LAMP采用四種專門設(shè)計的引物(兩個內(nèi)引物和兩個外引物),可識別目標DNA中的六個不同區(qū)域。四種引物與目標DNA的雜交對于LAMP的效率來說是很關(guān)鍵的一步。因此,這四種引物的設(shè)計對于成功的測定很關(guān)鍵。
避免交叉同源
LAMP Designer會自動解釋BLAST搜索結(jié)果并避開這些區(qū)域來設(shè)計與數(shù)據(jù)庫具有顯著交叉同源性的引物。
驗證BLAST
可以針對數(shù)據(jù)庫對引物進行BLAST搜索以驗證它們的特異性。
多重LAMP引物組
可以檢查為序列設(shè)計的引物的多重性。程序顯示設(shè)計的引物之間穩(wěn)定的交叉同源性的自由能。
導出結(jié)果
設(shè)計的引物組及其屬性可以以標準csv或excel格式導出。
數(shù)據(jù)和數(shù)據(jù)庫管理
可以創(chuàng)建多個項目。通過為每個實驗創(chuàng)建單獨的項目,可以輕松管理多個實驗的數(shù)據(jù)。它維護一個用于序列信息和搜索結(jié)果的本地數(shù)據(jù)庫。
系統(tǒng)要求:
| 對于Windows | 需要 | 推薦 |
| CPU | Pentium IV 1.80 GHz | Intel Core i3 (3rdGen) |
| 內(nèi)存 | 1GB可用RAM | 2GB或更高的可用RAM |
| 硬盤空間 | 500MB可用硬盤 | 1GB可用硬盤 |
| 屏幕分辨率 | 800×600 | 1024×768 |
Windows支持的平臺: XP/Vista/Windows 7/Windows 8/Windows 10