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LAMP Designer可以設(shè)計(jì)用于環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增測(cè)定的引物,在等溫條件下擴(kuò)增DNA和RNA序列,無需PCR設(shè)置。該技術(shù)依賴于自動(dòng)循環(huán)和DNA聚合酶介導(dǎo)的鏈置換DNA合成。在不到一小時(shí)的時(shí)間內(nèi)將幾個(gè)DNA拷貝擴(kuò)增到109.逆轉(zhuǎn)錄偶聯(lián)LAMP可用于RNA序列的擴(kuò)增。
LAMP Designer特征:
設(shè)計(jì)用于環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增的引物
LAMP采用四種專門設(shè)計(jì)的引物(兩個(gè)內(nèi)引物和兩個(gè)外引物),可識(shí)別目標(biāo)DNA中的六個(gè)不同區(qū)域。四種引物與目標(biāo)DNA的雜交對(duì)于LAMP的效率來說是很關(guān)鍵的一步。因此,這四種引物的設(shè)計(jì)對(duì)于成功的測(cè)定很關(guān)鍵。
避免交叉同源
LAMP Designer會(huì)自動(dòng)解釋BLAST搜索結(jié)果并避開這些區(qū)域來設(shè)計(jì)與數(shù)據(jù)庫(kù)具有顯著交叉同源性的引物。
驗(yàn)證BLAST
可以針對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)引物進(jìn)行BLAST搜索以驗(yàn)證它們的特異性。
多重LAMP引物組
可以檢查為序列設(shè)計(jì)的引物的多重性。程序顯示設(shè)計(jì)的引物之間穩(wěn)定的交叉同源性的自由能。
導(dǎo)出結(jié)果
設(shè)計(jì)的引物組及其屬性可以以標(biāo)準(zhǔn)csv或excel格式導(dǎo)出。
數(shù)據(jù)和數(shù)據(jù)庫(kù)管理
可以創(chuàng)建多個(gè)項(xiàng)目。通過為每個(gè)實(shí)驗(yàn)創(chuàng)建單獨(dú)的項(xiàng)目,可以輕松管理多個(gè)實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù)。它維護(hù)一個(gè)用于序列信息和搜索結(jié)果的本地?cái)?shù)據(jù)庫(kù)。
系統(tǒng)要求:
| 對(duì)于Windows | 需要 | 推薦 |
| CPU | Pentium IV 1.80 GHz | Intel Core i3 (3rdGen) |
| 內(nèi)存 | 1GB可用RAM | 2GB或更高的可用RAM |
| 硬盤空間 | 500MB可用硬盤 | 1GB可用硬盤 |
| 屏幕分辨率 | 800×600 | 1024×768 |
Windows支持的平臺(tái): XP/Vista/Windows 7/Windows 8/Windows 10