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產(chǎn)品報(bào)價(jià)： ￥10000元

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產(chǎn)品熱度：加載中

品　　牌：SimLipid

產(chǎn)品型號(hào)：高通量脂質(zhì)鑒定和定量軟件

適用范圍：高教 職教

所在地區(qū)：

溫馨提示：需求數(shù)量不同，價(jià)格不同。請(qǐng)聯(lián)系我們，確認(rèn)當(dāng)前新的報(bào)價(jià)！

SimLipid是一種高通量脂質(zhì)鑒定和定量軟件。它可以處理來自數(shù)百個(gè)LC-MS和MS/MS實(shí)驗(yàn)運(yùn)行的原始數(shù)據(jù)，用于LC峰檢測(cè)、峰拾取、分子特征發(fā)現(xiàn)和保留時(shí)間校準(zhǔn)。原始數(shù)據(jù)或峰列表（包含已處理的LC-MS數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)集）可以進(jìn)行MS和MS/MS數(shù)據(jù)庫搜索以進(jìn)行結(jié)構(gòu)解析，即使在批處理的模式下也是如此。專有的評(píng)分機(jī)制可區(qū)分每次MS/MS掃描的等壓候選結(jié)構(gòu)。

SimLipid特點(diǎn)：

強(qiáng)的脂質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫

SimLipld數(shù)據(jù)庫是一個(gè)可擴(kuò)展的關(guān)系數(shù)據(jù)庫，包含9種脂質(zhì)類別，即Carnitines, Fatty acyls, Glycerolipids, Glycerophospholipids, Polyketides, Prenols, Saccharolipids, Sphingolipids和Sterols。該數(shù)據(jù)庫存儲(chǔ)了40,312種脂質(zhì)和15,08,293種結(jié)構(gòu)特定的MS/MS特征離子。除此之外，該數(shù)據(jù)庫還存儲(chǔ)了5227個(gè)前體掃描和中性損失掃描三重四極桿質(zhì)譜法的轉(zhuǎn)換，分別對(duì)應(yīng)于glycerophospholipids, glycerolipids, 和sphingolipids的1,179、393和221個(gè)特有的脂肪?；?。

用戶可以創(chuàng)建自定義數(shù)據(jù)庫*來存儲(chǔ)精選脂質(zhì)以及保留時(shí)間和漂移時(shí)間。創(chuàng)建自定義數(shù)據(jù)庫后，可以使用保留時(shí)間和漂移時(shí)間容差作為初始搜索謂詞來執(zhí)行用于脂質(zhì)結(jié)構(gòu)鑒定的MS和MS/MS數(shù)據(jù)庫搜索。此功能便于用戶創(chuàng)建LC-MS或Ion Mobility-MS模板；從而使他們能夠利用LC-MS和IMS技術(shù)進(jìn)行研究。

其他數(shù)據(jù)庫鏈接包括Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG)、人類代謝組數(shù)據(jù)庫（HMDB）、生物感興趣的化學(xué)實(shí)體（CEBI）、PubChem物質(zhì)數(shù)據(jù)庫、LIPIDBANK和LIPIDAT。數(shù)據(jù)庫不斷更新。

圖1：SimLipid數(shù)據(jù)庫的示意圖

請(qǐng)注意：* 該功能在程序的企業(yè)版中可用

項(xiàng)目管理和數(shù)據(jù)可視化

SimLipid提供項(xiàng)目管理，將脂質(zhì)分析結(jié)果與輸入配置文件和搜索參數(shù)相關(guān)聯(lián)。您可以創(chuàng)建任意數(shù)量的項(xiàng)目。您還可以批量導(dǎo)入數(shù)百個(gè)原始數(shù)據(jù)文件。來自實(shí)驗(yàn)性MS運(yùn)行的原始數(shù)據(jù)：總離子色譜圖、已鑒定的脂質(zhì)、MS或MS/MS光譜，以及它們相應(yīng)的數(shù)據(jù)庫信息都顯示在一個(gè)工作臺(tái)中。

圖 2：SimLipid軟件的典型圖形用戶界面：一個(gè)單一的工作臺(tái)，使您能夠可視化LC-MS、ESI-MS、MALDI-MS實(shí)驗(yàn)掃描的原始數(shù)據(jù)、執(zhí)行數(shù)據(jù)庫搜索后的結(jié)果以及已識(shí)別的相應(yīng)信息脂質(zhì)。

SimLipid提供以下附加功能：

1. 對(duì)應(yīng)于指定保留時(shí)間窗口和/或前體m/z范圍的平均MS和MS/MS掃描。

2. 根據(jù)支持的文件格式的前體離子 m/z、電荷狀態(tài)、保留時(shí)間、強(qiáng)度和漂移時(shí)間對(duì)加載的數(shù)據(jù)集進(jìn)行排序。

3. 識(shí)別脂質(zhì)的掃描/光譜用顏色編碼，旁邊顯示已識(shí)別脂質(zhì)的名稱/縮寫/分子式。

4. 查看目標(biāo)m/z的提取離子色譜圖。

高通量MS脂質(zhì)搜索

SimLipid通過針對(duì)SimLipid數(shù)據(jù)庫中Carnitines, Fatty acyls, Glycerolipids, Glycerophospholipids, Polyketides, Prenols, Saccharolipids, Sphingolipids和Sterols的已知脂質(zhì)結(jié)構(gòu)搜索脂質(zhì)前體離子，從多個(gè)MS峰列表數(shù)據(jù)中實(shí)現(xiàn)高通量脂質(zhì)分析。用戶可以對(duì)誤差容限小于或等于50ppm或2000milliDalton(mDa)的高分辨率數(shù)據(jù)執(zhí)行MS脂質(zhì)搜索。SimLipid支持正離子模式下的[M+H]、[M+NH4]、[M+Na]、[M+C5H12N]、[M+Li]離子和[M-H]、[M+AcO]、[M +Cl]、[M-CH3]、[M+OAcO]和[M+HCOO]在負(fù)離子模式下。用戶還可以從MS脂質(zhì)譜觸發(fā)產(chǎn)物離子數(shù)據(jù)分析?？梢允褂煤蜻x脂質(zhì)種類的產(chǎn)物離子數(shù)據(jù)來驗(yàn)證對(duì)應(yīng)于前體m/z的輪廓脂質(zhì)。用戶可以從預(yù)定義的m/z值和相應(yīng)離子種類列表中導(dǎo)入已包含在高通量搜索中的前體m/z值的離子種類。這有助于在可變離子模式和不同的加合物中進(jìn)行MS/MS搜索。有多個(gè)選項(xiàng)可用于根據(jù)保留時(shí)間、前體m/z和強(qiáng)度選擇要包含在批次運(yùn)行中的MS和MS/MS配置文件。

使用MS/MS和MS^E數(shù)據(jù)進(jìn)行高通量脂質(zhì)結(jié)構(gòu)解析

SimLipid支持使用來自Carnitines, Fatty acyls, Glycerolipids, Glycerophospholipids, Polyketides, Prenols, Saccharolipids, Sphingolipids和Sterols的MS/MS和MS^E光譜的前體和產(chǎn)物離子m/z數(shù)據(jù)對(duì)脂質(zhì)進(jìn)行結(jié)構(gòu)解析。已識(shí)別的脂質(zhì)根據(jù)一種排序算法進(jìn)行評(píng)分，該算法表明理論脂質(zhì)與實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的相對(duì)接近程度?？梢苑治鼍哂?.001-50ppm和0.1到2,000milliDalton (mDa) 之間誤差容限的高分辨率準(zhǔn)確質(zhì)量數(shù)據(jù)。

多重前體離子掃描（PIS）和中性損失掃描（NLS）三重四極桿質(zhì)譜法基于脂質(zhì)分析和定量的方法

來自多個(gè)PIS/NLS的數(shù)據(jù)可以使用原生文件格式或標(biāo)準(zhǔn)格式導(dǎo)入SimLipid軟件。用戶可以通過根據(jù)生物/技術(shù)復(fù)制對(duì)數(shù)據(jù)文件進(jìn)行分類，在SimLipid中對(duì)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)進(jìn)行建模。基于target fatty acyls/head group fragment ions或其中性損失的脂質(zhì)鑒定以批處理模式進(jìn)行。

SimLipid能夠量化對(duì)應(yīng)于MS光譜上觀察到的峰的脂質(zhì)。量化是通過根據(jù)所選內(nèi)標(biāo)的觀察強(qiáng)度對(duì)強(qiáng)度值進(jìn)行歸一化來完成的。該程序有助于將內(nèi)源性/外源性脂質(zhì)規(guī)范為內(nèi)部標(biāo)準(zhǔn)。為了能夠從低分辨率光譜中定量脂質(zhì)，SimLipid校正了同位素重疊的強(qiáng)度。這有助于準(zhǔn)確量化生物混合物中的脂質(zhì)。量化數(shù)據(jù)以及其他信息（例如峰m/z、分子式、不同樣品中的校正、未校正和歸一化強(qiáng)度）可以導(dǎo)出為與電子表格兼容的.csv和.xls格式。

LC MS和LC-MS/MS高通量數(shù)據(jù)處理

SimLipid處理LC-MS和MS/MS數(shù)據(jù)以進(jìn)行峰檢測(cè)、平滑、色譜解卷積、峰去同位素和分子特征查找。該程序?qū)z測(cè)到的峰值m/z值與相應(yīng)的MS/MS光譜對(duì)齊，從而能夠使用來自MS和MS/MS數(shù)據(jù)的前體和產(chǎn)物離子數(shù)據(jù)識(shí)別脂質(zhì)結(jié)構(gòu)。

圖 3：使用MPIS/NLS QqQ MS方法數(shù)據(jù)的SimLipid軟件脂質(zhì)分析和定量工作流程示意圖

SimLipid還有助于對(duì)從不同生物樣品中鑒定的脂質(zhì)進(jìn)行比較和定量分析。使用RANSAC技術(shù)，根據(jù)保留時(shí)間、m/z值、觀察到的強(qiáng)度和電荷狀態(tài)的一致性，對(duì)從不同峰列表中檢測(cè)到的峰進(jìn)行對(duì)齊。至多可以對(duì)齊200個(gè)峰值列表，結(jié)果可以導(dǎo)出為HTML、CSV和MS Excel格式。

SimLipid軟件提供LC-MS峰列表的單一工作臺(tái)視圖；在實(shí)驗(yàn)性LC-MS運(yùn)行中確定的脂質(zhì)列表；在特定保留時(shí)間鑒定的脂質(zhì)結(jié)構(gòu)；數(shù)據(jù)庫中已識(shí)別脂質(zhì)的相關(guān)信息；和總離子色譜圖，在已識(shí)別脂質(zhì)的保留時(shí)間處帶有垂直條。

圖 4：SimLipid軟件的典型圖形用戶界面：LC-MS峰列表的單一工作臺(tái)視圖、在保留時(shí)間點(diǎn)識(shí)別的脂質(zhì)列表、在選定保留時(shí)間點(diǎn)的脂質(zhì)結(jié)構(gòu)以及帶有垂直線的樣品色譜圖表示顯示的脂質(zhì)結(jié)構(gòu)的保留時(shí)間點(diǎn)。

鑒定脂質(zhì)的質(zhì)譜注釋

SimLipid使用脂質(zhì)注釋質(zhì)譜，并為MS、MS/MS以及MS^E識(shí)別碎片離子。這有助于通過突出顯示與產(chǎn)品數(shù)據(jù)庫中的理論脂質(zhì)結(jié)構(gòu)相匹配的實(shí)驗(yàn)m/z值來解釋質(zhì)譜。

注釋的質(zhì)譜可以調(diào)整/重新調(diào)整大小以適合頁面或基于感興趣的區(qū)域。用戶可以使用鼠標(biāo)光標(biāo)或通過指定m/z范圍來放大/縮小到特定的繪圖位置。此外，用戶可以將到注釋的光譜導(dǎo)出為可包含MS PowerPoint中的圖像（PNG和JPEG格式），從而促進(jìn)研究小組之間的信息共享。

圖 5：SimLipid軟件的典型圖形用戶界面：已識(shí)別脂質(zhì)TG(56:3) 的注釋MS/MS光譜。光譜中觀察到的兩個(gè)強(qiáng)峰分別對(duì)應(yīng)于結(jié)構(gòu)的特有脂肪酸鏈的特征離子18:1和20:1。

生成報(bào)告

分析質(zhì)譜數(shù)據(jù)后，用戶可以從50,000個(gè)MS和MS/MS配置文件中生成HTML、csv和MS Excel格式的目標(biāo)導(dǎo)向報(bào)告。用戶可以將SimLipid設(shè)置為在執(zhí)行分析后自動(dòng)啟動(dòng)報(bào)告?？梢陨傻膱?bào)告用于：

• Profiled MS Spectra：可以為生物標(biāo)志物研究生成不同生物樣品中存在的異質(zhì)脂質(zhì)豐度的比較分析。

• MS和MS/MS數(shù)據(jù)：報(bào)告顯示與在MS搜索中通常遇到的前體m/z值相對(duì)應(yīng)的誤報(bào)，以及在子離子數(shù)據(jù)分析期間識(shí)別的脂質(zhì)的概率分?jǐn)?shù)。這樣的報(bào)告是通過結(jié)合MS脂質(zhì)譜及其互補(bǔ)的MS/MS或MS^E脂質(zhì)譜生成的。

• 多個(gè)數(shù)據(jù)集：一份報(bào)告，其中包含對(duì)從不同離子模式和加合物中獲得的不同MS或MS/MS光譜分析的脂質(zhì)進(jìn)行比較分析。

• Retention Time：該報(bào)告使用戶能夠通過根據(jù)保留時(shí)間對(duì)齊MS/MS曲線來研究在可變離子模式下采集的MS/MS光譜中觀察到的碎片離子。這提供了一個(gè)工作流程解決方案，用于識(shí)別屬于GP、SP、GL等類別的未知脂質(zhì)的結(jié)構(gòu)，其中對(duì)應(yīng)于脂肪酸鏈的診斷離子在陰性光譜中被觀察到，而對(duì)應(yīng)于head group的診斷離子在陽性離子光譜中被觀察到。

圖 6：使用導(dǎo)出到MS excel文件的MS/MS數(shù)據(jù)識(shí)別的脂質(zhì)。

數(shù)據(jù)庫搜索

您還可以通過脂質(zhì)縮寫/通用名稱、質(zhì)量、化學(xué)成分或脂質(zhì)ID搜索感興趣的脂質(zhì)結(jié)構(gòu)。

系統(tǒng)要求：

Windows支持的平臺(tái)：Vista/Windows 7/Windows 8/Windows 10