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SnapGene 是一款強大的多功能的分子生物學工具，能夠非常直觀的注釋分析和DNA圖譜，用于創(chuàng)建和共享豐富的注釋文件，幫助用戶準確清晰地為分子生物學繪制相關圖形，生物相關專業(yè)的用戶不要錯過！
SnapGene可幫助用戶快速計劃，可視化和記錄您的日常分析生物學程序，并為大家提供更安全快速的方法，現(xiàn)在每個DNA構建體都可以用豐富的電子格式記錄，它節(jié)省了大量的時間和金錢，并且方便使用者快速發(fā)現(xiàn)問題，制作更加優(yōu)化的決策和方案，軟件界面友好，使用簡單，記錄全面，是一個非常理想的工具。
特征
DNA可視化
查看DNA序列的多個視圖
地圖：自定義，酶位點，特征，引物，ORF，DNA顏色等的顯示。地圖可以是圓形或線性格式
序列：使用雙鏈模式查看酶位點，具有翻譯，引物和DNA顏色的特征。單鏈模式顯示具有彩色特征的緊湊概覽
酶：從一系列酶組中選擇。剪切網(wǎng)站可以顯示為數(shù)字或行，按名稱或頻率排序
特征：按名稱、位置、大小、顏色，方向性或類型對帶注釋的要素列表進行排序。復選框在緊湊或完全展開的顯示之間的切換。
引物：按名稱、位置、大小、顏色、方向性或類型對帶注釋的要素列表進行排序。復選框在緊湊或完全展開的顯示之間的切換。
歷史：查看DNA構建體的自動生成的圖形歷史記錄。
大序列支持
查看：利用SnapGene的數(shù)據(jù)處理功能，掃描具有數(shù)千個帶注釋功能的大型DNA序列
搜索：使用專有的MICA算法即時在染色體內(nèi)找到序列
縮放：使用多功能控件調(diào)整縮放系數(shù)和顯示區(qū)域
蛋白質(zhì)可視化
查看蛋白質(zhì)序列的多個視圖
地圖：自定義區(qū)域、站點、鍵和序列顏色的顯示
系列：使用具有相關特征的1或3個字母的氨基酸代碼查看蛋白質(zhì)序列
屬型：查看蛋白質(zhì)的分子量，消光系數(shù)，等電點和氨基酸組成?？梢詫Φ鞍踪|(zhì)的選定部分進行相同的分析
特征：按名字、位置、大小、顏色或類型對帶注釋的功能列表進行排序。復選框在緊湊或完全展開的顯示之間的切換
歷史：查看自動生成的蛋白質(zhì)序列圖形歷史記錄。祖先蛋白質(zhì)或DNA序列可以作為單獨的文件再生
直觀的序列編輯
輕松編輯DNA和蛋白質(zhì)序列
標準編輯：進行插入、刪除、替換和大小更改。復制并粘貼序列時，會自動傳輸功能
DNA結束：編輯線性DNA序列的末端以添加或去除突出端或磷酸酯
序列顏色編碼
將選定的DNA或氨基酸序列設置為十種顏色之一
給兩條DNA鏈或蛋白質(zhì)序列著色。顏色在Map和Sequence視圖中都可見
特征注釋
自動特征檢測：使用SnapGene廣泛的數(shù)據(jù)庫查找DNA序列中的常見特征，您選擇的其他功能可以添加到自定義數(shù)據(jù)庫中
手動特征注釋：選擇DNA或蛋白質(zhì)序列的一部分，并使用靈活的GenBank兼容空間注釋特征
模擬
SnapGene提供優(yōu)雅、信息豐富的窗口，用于模擬各種常見的克隆換個PCR方法
限制性站點指標：確認限制性網(wǎng)站適合克隆
獨特性：以粗體顯示獨特的限制性位點或選擇自動定義的Unique Cutters或Unique 6+ Cutters酶組
甲基化敏感性：限制性位點被Dam , Dcm或EcoKI甲基化阻斷。SnapGene將自動用星號標記該站點
特殊性質(zhì)：利用工具提示來避免有問題的限制網(wǎng)站
限制性克隆
可視化克隆過程的所有方面
如果您已經(jīng)準備好了一個過程，那么模擬僅需幾秒鐘。如果克隆過程存在設計缺陷，則可以捕獲并糾正錯誤。
聚合酶鏈反應
模擬標準PCR
使用您自己的引物，或要求SnapGene自動設計引物。產(chǎn)品文件在其歷史記錄上存儲模板和引物。
重疊延伸PCR
通過重疊延伸PCR融合片段
多組裝八個碎片。選擇要連接的片段及其方向，SnapGene將設計引物。
引物定向誘變
使用誘變隱去進行定點誘變
選擇誘變引物，然后按一個按鈕以查看修飾的質(zhì)粒。歷史顏色突出了突變。
網(wǎng)關克隆
模擬網(wǎng)關BP克隆或LR克隆，或兩者在同一時間
為了方便起見，提供了公共的供體向量和目的向量。選擇要組裝的片段，Snap Gene將設計引物。
Gibson組裝
通過融合多達八個片段或通過將多達八個片段插入向量來模擬Gibson Assembly。Gibson Assembly是一種流行的無縫克隆方法。
選擇要融合的片段及其方向，Snap Gene將設計引物。線性化的載體可以通過酶消化或反向PCR產(chǎn)生。
IN-FUSION克隆
通過將多八個片段插入載體來模擬Clontech的In-Fusion克隆。融合克隆是創(chuàng)建無縫基因融合的一種非常通用的方法。
選擇要融合的片段及其方向，Snap Gene將設計引物。線性化的載體可以通過酶消化或反方向PCR產(chǎn)生。
TA和GC克隆
通過TA或GC克隆捕獲PCR產(chǎn)物
選擇常規(guī)TA克隆或高校GC克隆
為了方便起見，通過了常見的TA克隆載體和Lucigen的GC克隆載體。
退火寡核苷酸
將兩個寡核苷酸退火以形成雙鏈產(chǎn)物
使用簡單的控件添加突出端以進行限制性克隆。
避免錯誤
使用SnapGene確保所需的結構是正確的，并確認已獲得所需的序列。
基因融合閱讀框
確保構造中的翻特征在框架中。
鏈接的翻譯
使用“序列”視圖可以一目了然的查看兩個已翻譯的要素是否在框架中。如果這樣，翻譯將鏈接在同一行上。如果不是，則翻譯在單獨的行上。
與參考序列比對
使用功能強大的對齊工具檢查實際結構是否與模擬結構匹配。
映射概述
查看比對序列與參考序列匹配的地方以及存在差異的概述。
序列詳細信息
自動記錄
SnapGene自動記錄操作以創(chuàng)建圖形歷史記錄，并將原型構造在終文件中。
全面的“撤銷”功能
撤銷幾何所有操作。
不要為嘗試SnapGene文件而感到害羞—重復步驟很容易。
歷史和原型
查看構造的圖形歷史記錄
單擊操作以突出顯示親本和產(chǎn)物序列的相關部分，或單擊PCR引物名稱以查看引物序列。
在歷史樹中單擊一個原型，以重新生成該原型序列文件，包括其注釋和克隆歷史記錄。
歷史顏色
使用可選的歷史記錄顏色來標識序列的更改
查看有關組裝結構的詳細信息，包括結扎的粘性末端。
擁有您的數(shù)據(jù)
SnapGene使您可以選擇讀取和共享文件，同時保持對數(shù)據(jù)的完全控制。
安全文件管理
將SnapGene文件保存在所需的位置。
使用計算機上熟悉的安全操作系統(tǒng)來存儲和組織SnapGene文件，
從其他格式導入
讀取許多常見的文件格式
不僅導入DNA序列，還導入注釋。將繼續(xù)開發(fā)進口商，以確保您不會被鎖定為專有文件格式。
導出為標準格式
將序列，圖譜或凝膠圖像轉換為標準格式。將地圖或模擬的窮糖凝膠導出為常見的圖像格式。
與SnapGene Viewer共享數(shù)據(jù)
只需將文件和鏈接發(fā)送到SnapGene Viewer。就像完整的SnapGene界面一樣，收件人將能夠看到圖，序列和注釋。
SnapGene 7.0引入了更新的外觀和增強的數(shù)據(jù)管理功能。使用選項卡輕松導航文件和文件夾，并直接從新文件夾面板執(zhí)行基于序列和元數(shù)據(jù)的文件搜索。其他增強功能包括新的引物插入注釋和各種可用性改進。
選項卡式界面
使用新的選項卡式界面在文檔之間導航，或?qū)⑽臋n彈出到單獨的窗口中以進行比較。
文件和文件夾管理
選擇文件系統(tǒng)上的任意文件夾作為項目，并直接在新的可折疊文件夾面板中快速查看子文件夾和文件。執(zhí)行標準文件運作并快速瀏覽所有支持的文件類型。
文件搜索
通過靈活、現(xiàn)代的界面，使用名稱或類型、包含序列、特征注釋等屬性在項目中快速查找文件。
入門注釋
在更新的添加/編輯引物對話框中可視化添加到引物的插入，例如酶、密碼子或短肽序列。感興趣的區(qū)域（Golden Gate限制位點、Gateway克隆attB位點、定向TOPO基序）現(xiàn)在也為自動設計的引物進行了注釋。
預覽檢驗到的新序列特征
新的文件窗格現(xiàn)在包含一個序列圖，用于預覽序列中檢驗到的特征，并允許您選擇要包含在序列中的注釋。
開始
使用新的“入門”窗格快速訪問近來的文件和文件夾，或通過指向短視頻教程、用戶指南文章和SnapGene學院的鏈接了解有關如何使用 SnapGene 的更多信息。
系統(tǒng)操作要求：
Windows
SnapGene 5.1 - 6.0：Windows 7或更高版本（64位僅適用于Intel）。
SnapGene 6.1 - 7.0：Windows 10或更高版本（64位僅適用于Intel）。
基于ARM的計算機構建的Windows不支持SnapGene。
macOS
SnapGene 5.2.5或更早版本：macOS 10.12。
SnapGene 5.3 - 6.0：macOS 10.13或更高版本。
SnapGene 6.1 - 7.0：macOS 10.14或更高版本。
基于Apple ARM的計算機原生支持SnapGene 6.1版及更高版本。
Linux
SnapGene 4.0 - 5.2：Ubuntu 16.04、RedHat 6.6和7.2。
Snapgene 5.3 - 6.0：Ubuntu 18.04、CentOS 7 (1810)或RedHat 7.6。
SnapGene 6.1 - 7.0：Ubuntu 20.04、CentOS 8 (2105)或RedHat 8.4。
為基于ARM的計算機構建的Linux 不支持SnapGene。
硬件要求
| 內(nèi)存 | 1GB以上 |
| 硬盤 | 250MB可用磁盤空間 |
| 顯示 | 分辨率1440×900或更高分辨率 |
