可靠的科研軟件包 | 多目標(biāo)優(yōu)化的藥物研發(fā)。研究者在優(yōu)化生物化學(xué)的有效性進(jìn)的同時(shí)還須對(duì)諸如ADME及毒性等其他性質(zhì)進(jìn)行優(yōu)化。軟件開發(fā)建立在BIOVIA Pipeline Pilot及基于多年同行評(píng)審研究建立的黃金應(yīng)用標(biāo)準(zhǔn)（例如，CHARMm、MODELER、ZDock、Delphi、Catalyst、DMol3、Vamp、TopKat、AggMap及Developability Index）基礎(chǔ)之上，BIOVIA Material Studio為生命科學(xué)研究提供了功能全面、量化性、協(xié)作性的研究平臺(tái)。 |
BIOVIA Discovery Studio
BIOVIA Discovery Studio的開發(fā)基于BIOVIA PipelinePilot，是功能全面的科學(xué)應(yīng)用軟件。軟件兼具有開放性、可量化性、協(xié)作性，是面向當(dāng)今生命科學(xué)研究需求而開發(fā)的獨(dú)特的研究工具。
l全面的科研軟件包
?面向科研需求，為從早期研發(fā)至臨床前期、生物制藥配方開發(fā)提供了科學(xué)的解決方案
l成熟的科學(xué)原理
?擁有30多年的同行評(píng)審研究成果為Discovery Studio的科學(xué)核心提供支撐
l協(xié)作研究
?基于DS Visualizer，Discovery Studio為研發(fā)提供了真正全面的可視化及協(xié)作框架
lDiscovery Studio：基于Pipeline Pilot應(yīng)用
?Discovery Studio的每個(gè)任務(wù)皆基于Pipeline Pilot協(xié)議，以確保建模與模擬環(huán)境的開放性
?可對(duì)研究進(jìn)行自定義及擴(kuò)展
?可擴(kuò)展架構(gòu)
?可部署的工作流程
?為創(chuàng)新提供支持
?可與第三方應(yīng)用集成，包括CCDC GOLD*及伊利諾伊大學(xué)厄巴納-香檳分校的NAMD?
?Discovery Studio擁有Pipeline Pilot下述組件的分許可：Core、Integration、Reporting、Chemistry、Sequence Analysis、ADMET
功能全面的科學(xué)預(yù)測(cè)軟件
l模擬：
?基于BIOVIA CHARMm?力場(chǎng)引擎，可為單點(diǎn)能、小化、分子動(dòng)力學(xué)模擬及自由能計(jì)算提供的模擬結(jié)果
?基于從頭算DFT量子力學(xué)的DMol3、半經(jīng)驗(yàn)（VAMP）及QM/MM雜化算法（DMol3/CHARMm）
l大分子設(shè)計(jì)與分析：
?市場(chǎng)的同源模型算法MODELER
?基于pH值的蛋白質(zhì)電離工具
?基于pH值的蛋白質(zhì)穩(wěn)定性及親和力突變的獨(dú)特分析
?使用ZDOCK對(duì)蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)對(duì)接進(jìn)行可靠預(yù)測(cè)
l抗體研發(fā)
?功能完善的針對(duì)抗體研究的結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)及模擬工具
?成熟自動(dòng)化結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)工作流，用于開發(fā)尋找抗體的同源模型
?的AggMap蛋白質(zhì)聚集及Developability Index
?快速鑒定生物藥劑蛋白質(zhì)翻譯后修飾（PTM）相關(guān)的模體序列
l基于結(jié)構(gòu)的設(shè)計(jì)（SBD）
?基于物理性質(zhì)（CHARMm CDOCKER）的獨(dú)特對(duì)接引擎
?包括對(duì)期望的、不期望的及不符合相互作用類型的獨(dú)有的非鍵分析檢測(cè)
?基于MMP的獨(dú)特的活性懸崖檢查
l基于片段的設(shè)計(jì)（FBD）
?利用經(jīng)典藥物化學(xué)反應(yīng)進(jìn)行原位枚舉,利用ca.10k從BIOVIA ACD預(yù)篩選試劑
?使用ca.來(lái)自BIOVIA SCD的150萬(wàn)種商用化合物支架跳躍
?獨(dú)特的KarplusMCSS（多拷貝同時(shí)搜尋法）片段對(duì)接引擎
l基于藥效團(tuán)及配體的設(shè)計(jì)：
?市場(chǎng)的CATALYST藥效團(tuán)引擎
?生成獨(dú)特的受體-配體藥效團(tuán)
?的經(jīng)過(guò)驗(yàn)證的配體分析數(shù)據(jù)庫(kù)PharmaDB
lQSAR、ADMET及TOPKAT預(yù)測(cè)毒理學(xué)
?QSAR：可計(jì)算物化性質(zhì)、拓?fù)渲讣y性質(zhì)并生成PLS、GFA、MLR等
?全面的ADMET及預(yù)測(cè)毒理學(xué)模型，包括腦血屏障滲透、肝毒性、CYP2D6、AMES、大鼠經(jīng)口半數(shù)致死劑量等
lX-射線
?利用CNX生成電子密度圖、圖片精修，及利用HT-X PIPE對(duì)蛋白質(zhì)-配體絡(luò)合物進(jìn)行自動(dòng)結(jié)構(gòu)測(cè)定
