
可靠的科研軟件包 | 多目標(biāo)優(yōu)化的藥物研發(fā)。研究者在優(yōu)化生物化學(xué)的有效性進的同時還須對諸如ADME及毒性等其他性質(zhì)進行優(yōu)化。軟件開發(fā)建立在BIOVIA Pipeline Pilot及基于多年同行評審研究建立的黃金應(yīng)用標(biāo)準(zhǔn)(例如,CHARMm、MODELER、ZDock、Delphi、Catalyst、DMol3、Vamp、TopKat、AggMap及Developability Index)基礎(chǔ)之上,BIOVIA Material Studio為生命科學(xué)研究提供了功能全面、量化性、協(xié)作性的研究平臺。 |
BIOVIA Discovery Studio
BIOVIA Discovery Studio的開發(fā)基于BIOVIA PipelinePilot,是功能全面的科學(xué)應(yīng)用軟件。軟件兼具有開放性、可量化性、協(xié)作性,是面向當(dāng)今生命科學(xué)研究需求而開發(fā)的獨特的研究工具。
l全面的科研軟件包
?面向科研需求,為從早期研發(fā)至臨床前期、生物制藥配方開發(fā)提供了科學(xué)的解決方案
l成熟的科學(xué)原理
?擁有30多年的同行評審研究成果為Discovery Studio的科學(xué)核心提供支撐
l協(xié)作研究
?基于DS Visualizer,Discovery Studio為研發(fā)提供了真正全面的可視化及協(xié)作框架
lDiscovery Studio:基于Pipeline Pilot應(yīng)用
?Discovery Studio的每個任務(wù)皆基于Pipeline Pilot協(xié)議,以確保建模與模擬環(huán)境的開放性
?可對研究進行自定義及擴展
?可擴展架構(gòu)
?可部署的工作流程
?為創(chuàng)新提供支持
?可與第三方應(yīng)用集成,包括CCDC GOLD*及伊利諾伊大學(xué)厄巴納-香檳分校的NAMD?
?Discovery Studio擁有Pipeline Pilot下述組件的分許可:Core、Integration、Reporting、Chemistry、Sequence Analysis、ADMET
功能全面的科學(xué)預(yù)測軟件
l模擬:
?基于BIOVIA CHARMm?力場引擎,可為單點能、小化、分子動力學(xué)模擬及自由能計算提供的模擬結(jié)果
?基于從頭算DFT量子力學(xué)的DMol3、半經(jīng)驗(VAMP)及QM/MM雜化算法(DMol3/CHARMm)
l大分子設(shè)計與分析:
?市場的同源模型算法MODELER
?基于pH值的蛋白質(zhì)電離工具
?基于pH值的蛋白質(zhì)穩(wěn)定性及親和力突變的獨特分析
?使用ZDOCK對蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)對接進行可靠預(yù)測
l抗體研發(fā)
?功能完善的針對抗體研究的結(jié)構(gòu)預(yù)測及模擬工具
?成熟自動化結(jié)構(gòu)預(yù)測工作流,用于開發(fā)尋找抗體的同源模型
?的AggMap蛋白質(zhì)聚集及Developability Index
?快速鑒定生物藥劑蛋白質(zhì)翻譯后修飾(PTM)相關(guān)的模體序列
l基于結(jié)構(gòu)的設(shè)計(SBD)
?基于物理性質(zhì)(CHARMm CDOCKER)的獨特對接引擎
?包括對期望的、不期望的及不符合相互作用類型的獨有的非鍵分析檢測
?基于MMP的獨特的活性懸崖檢查
l基于片段的設(shè)計(FBD)
?利用經(jīng)典藥物化學(xué)反應(yīng)進行原位枚舉,利用ca.10k從BIOVIA ACD預(yù)篩選試劑
?使用ca.來自BIOVIA SCD的150萬種商用化合物支架跳躍
?獨特的KarplusMCSS(多拷貝同時搜尋法)片段對接引擎
l基于藥效團及配體的設(shè)計:
?市場的CATALYST藥效團引擎
?生成獨特的受體-配體藥效團
?的經(jīng)過驗證的配體分析數(shù)據(jù)庫PharmaDB
lQSAR、ADMET及TOPKAT預(yù)測毒理學(xué)
?QSAR:可計算物化性質(zhì)、拓?fù)渲讣y性質(zhì)并生成PLS、GFA、MLR等
?全面的ADMET及預(yù)測毒理學(xué)模型,包括腦血屏障滲透、肝毒性、CYP2D6、AMES、大鼠經(jīng)口半數(shù)致死劑量等
lX-射線
?利用CNX生成電子密度圖、圖片精修,及利用HT-X PIPE對蛋白質(zhì)-配體絡(luò)合物進行自動結(jié)構(gòu)測定